根结线虫病为大棚甜瓜的重要病害，主要为害根系，一旦发生，病情通常较为严重，病株率常达%。采用以下方法可较为有效地防治甜瓜根结线虫。
1.做好农作物轮作措施。最好是水旱轮作，利用大棚空闲时季安排种植玉米、水稻轮作。
2.做好甜瓜采收后清园工作。在采收后10—15天清除病残体，及时清理病残根，减少线虫散落土中，是减少虫源、减少侵染、减少防治成本的有效方法。
3.做好无病虫害育苗措施。用无病土或专用育苗肥育苗，确保培育的瓜苗不带线虫，防止将线虫扩散蔓延。
4.封棚盖膜。高温暴晒加封棚盖膜闷晒可大大提高土壤温度，更加有效杀死土中线虫。
5.药剂防治。米乐尔3kg/每㎡，克线丹2kg/每㎡等。提前15天，每㎡施用荣宝（氰氨化钙）60—75kg，充分耙匀淋湿后盖薄膜。
6.严格检疫。不从病区调种苗，防止线虫远距离传播。
7.翻晒土壤。在种植前，提前20—30天深耕翻土，将土中线虫翻至土表进行暴晒，有效降低土壤中线虫量。
8.堆沤腐熟的有机肥。有机肥一定要堆沤腐熟，可在堆沤前与茶麸一起堆沤。对土壤中微生物和线虫等有杀灭和驱避作用。
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